北荣重离子中心耗资新台币45亿元，包括地下一层、地上四层。配置日立的重离子治疗系统，共两间治疗室，这也是日本日立公司海外输出的第一个重离子设备。重离子治疗费用在60万到140万新台币之间，医院方表示将为弱势群体患者预留2%的治疗能力。

北荣重离子中心从2008年开始筹划建构;2015年9月，润泰集团捐赠新台币15亿元，协助兴建主体建筑及加速器基座;2018年4月，与日立公司签订重离子治疗系统合同;2019年1月，举行动土典礼;2019年3月，正式动工建设;2020年6月，举行建筑及基座完工移交典礼;2022年5月11日，获得原子能委员会的“高强度辐射设施使用许可”;6月11日，获得“高强度辐射设施试运转许可”;6月15日，进行早期安全性与设备运转有效性临床试验;6月30日，开始进行临床试验。

目前，中国台湾已运营质子治疗中心3家，分别为林口长庚纪念医院质子治疗中心、高雄长庚纪念医院质子治疗中心、台北医学大学台北癌症中心质子治疗中心;在建质子治疗中心1家，为台湾大学医学院质子治疗中心。