NCCS Goh Cheng Liang质子治疗中心位于NCCS新建的大楼内，为东南亚地区首家质子治疗中心。该中心配置日立PROBEAT质子治疗系统，可提供点扫描技术，具有剂量驱动连续扫描(DDCS)功能(一种旨在提高质子剂量递送精度的创新技术)，RayStation是目前唯一可支持该功能的治疗计划系统。该中心包含4间旋转机架治疗室和1间固定束治疗室，治疗室同步配置室内成像系统，以准确定位患者实现精确的束流递送。
NCCS新建的大楼共24层，位于新加坡国立卫生研究院校园内，设有专门用于癌症护理和康复、研究和教育的设施。此外，还计划开发临床GMP设施，以支持免疫治疗的临床试验。大楼的建成将促进NCCS与SingHealth及杜克-新加坡国立大学癌症和干细胞生物学(CSCB)项目的合作。大楼于2017年6月2日动工，计划2022年完工。
目前，新加坡暂无已运营质子治疗中心，共有3家在建或拟建质子治疗中心，分别为NCCS Goh Cheng Liang质子治疗中心，配置日立PROBEAT质子治疗系统;新加坡高级医学研究所(Singapore Institute of Advanced Medicine Pte.)，配置瓦里安ProBeam®单室质子治疗系统;新加坡伊丽莎白诺维娜医院(Mount Elizabeth Novena Hospital)，配置IBA Proteus®ONE单室质子治疗系统。
